Националният доверителен екофонд е създаден през 1995 година чрез механизма на трансформиране на част от дълга на България в проекти за опазване на околната среда - сделката “Дълг срещу околна среда” – споразумение между правителствата на Конфедерация Швейцария и Република България.
За 30-те години на своята работа Националният доверителен екофонд е финансирал 515 проекта на общини, училища, университети, фирми, институти на БАН, неправителствени организации и др., намиращи се в над 150 общини. Общата има стойност е над 270 милиона лева. Предоставените средства от НДЕФ на бенефициентите възлизат на около 121 милиона лева, като средният процент на безвъзмездно финансиране е около 46 % (мин. 19%, макс. 85%).
Най-характерното за Националния доверителен екофонд през годините е, че винаги прави неща за първи път – без възможност да вземе готов модел и да го приложи. Винаги е имало нужда от творчество, основано на знания и достоверна информация. При управлението на конкретните проекти, които се финансират от НДЕФ, има по-ниска административна тежест в сравнение с други програми и се работи директно с бенефициентите. Те са партньори на Фонда.
